| Manual General de Organización de Administración Portuaria Integral de BCS |
| Manual Específico de Organización de la Dirección de Administración y Finanzas |
| Manual Específico de Organización de la Dirección de Comercialización y Operaciones |
| Manual Específico de Organización de la Dirección de Gestión Portuaria |
| Manual Específico de Organización de la Dirección de Ingeniería e Infraestructura Portuaria |
| Manual Específico de Organización de la Dirección General |
| Manual Especifíco de Organización de la Dirección Jurídica |
| Manual Específico de Organización de la Gerencia de Administración |
| Manual Específico de Organización de la Gerencia de Finanzas |
| Manual Específico de Organización de la Gerencia de Protección y Vigilancia |
| Manual Específico de Organización de la Gerencia de Puerto de Loreto-Puerto Escondido |
| Manual Específico de Organización de la Gerencia de Puerto de San Carlos |
| Manual Específico de Organización de la Gerencia de Puerto de Santa Rosalía |